En el nuevo Plan se diagnostican como los principales problemas de la situación actual los siguientes: 

1. La ausencia de un marco normativo suficientemente eficaz.
2. La ausencia de medios de control e inspección.
3. Deficiencias en la información disponible y en la idoneidad de las medidas de gestión.
4. Inexistencia de un marco de apoyo a la introducción de tecnologías limpias.
5. Insuficiente capacidad de tratamiento de los residuos generados. 
6. Ausencia de coordinación entre las actuaciones de los diversos departamentos sectoriales.
7. Escasos conocimientos a nivel ciudadano.

El Departamento Confederal de Ecología y Medio Ambiente de Comisiones Obreras considera que el nuevo Plan Nacional de Residuos Peligrosos ha incorporado algunos progresos con respecto al Plan anterior, principalmente, una estimación más realista sobre la generación de residuos peligrosos, una inversión en la descontaminación y recuperación de suelos, así como el hecho de que no contemple la construcción de incineradoras para la eliminación de residuos. No obstante, aún resulta un Plan poco ambicioso con respecto a varios aspectos importantes, que son comentados en el dossier.

Algunos ecologistas, empresarios y otros expertos aportan también su opinión sobre el nuevo Plan Nacional de Residuos Peligrosos.